Se utilizan para realizar análisis metalográficos, determinación de las estructuras, identificación de inclusiones, fases presentes, medición de tamaño de grano, determinación del espesor de capas modificadas, como en la nitruración o el cementado.​

También se realizan mediciones de áreas desgastadas, análisis de falla por corrosión, origen del picado y/o tipo de corrosión.​

Se utiliza una cámara adosada al microscopio, con un software especializado para asistir en las mediciones.​

Los microscopios que se encuentran en el GIS son:

• Microscopio Metalográfico Mikoba, hasta 800 aumentos, con cámara de video.
• Microscopio Metalográfico Zeiss.